O Programa Excelência na Gestão foi criado em maio de 1998, a partir de uma reunião realizada pela ABIPTI com a Fundação Nacional da Qualidade (FNQ) e institutos de pesquisa tecnológica associados à ABIPTI. O objetivo geral da iniciativa é promover a melhoria no desempenho das instituições de pesquisa tecnológica no país, visando torná-las mais competitivas. Nesse sentido, o processo de avaliação no âmbito do projeto deve representar para os IPTs um instrumento de gestão para o aprimoramento de suas atividades de pesquisa, desenvolvimento e serviços. 

O programa foi apoiado inicialmente pelo CNPq. A partir de 2004, a iniciativa passou a contar com o apoio do MCT e da Finep. Desde a sua implementação, mais de cem instituições de todo o país já participaram do projeto. Ao longo desses anos, foram realizados 80 cursos/eventos no seu âmbito. Outro resultado foi a capacitação de uma média de 18,8 mil pessoas.

O Programa Excelência na Gestão vinha atuando de forma ininterrupta ao longo desses últimos nove anos, o que tem permitido à ABIPTI e, sobretudo, aos próprios institutos, acumularem uma carga de aprendizado organizacional sem precedentes que tem resultado na melhoria da competitividade e no fortalecimento das instituições. 

Em 2008, devido aos trâmites do processo de aprovação do projeto junto à parceira e financiadora Finep, o ciclo de atividades não foi realizado e a estrutura do projeto passou, neste período, por modificações que serão implementadas a partir de 2009. 

Uma das novidades é a proposta de descentralizar as ações de apoio aos institutos, transferindo-as às lideranças regionais, ampliando as conexões entre os atores e fortalecendo o trabalho em rede. Com o projeto sendo distribuído pelas vice-presidências regionais, se espera, com isso, difundir e ampliar o conhecimento e as novas técnicas de gestão aos IPTs.

   No ano de 2000, visando agilizar a troca de informações entre o governo federal e os Sistemas Estaduais de Ciência, Tecnologia e Inovação, o Ministério da Ciência e Tecnologia (MCT) e suas agências propuseram a criação do Projeto de Informação e Comunicação para os Sistemas Estaduais de C&T, do qual fazem parte um portal e informativos: um online semanal e um impresso mensal. O ministro da C&T na época, Ronaldo Mota Sardenberg, solicitou que o seu secretário executivo escolhesse uma instituição que tivesse o perfil para realizar tal projeto. Foi assim que Carlos Américo Pacheco convocou a ABIPTI para elaborar a proposta do projeto, que foi batizado pela Associação como Gestão C&T. 

O projeto tem por objetivo:

- Ampliar as conexões entre MCT e as secretarias estaduais de C&T e fundações de amparo à pesquisa;
- Integrar e realizar a articulação política entre os sistemas locais de C&T
- Potencializar o intercâmbio de experiências municipais, estaduais e regionais
- Divulgar estudos setoriais e de oportunidades
- Representar a memória das atividades desenvolvidas pelos Sistemas Estaduais e Municipais de C&T
- Apoiar planos e programas de C&T nos âmbitos municipal, estadual, regional e federal.

   Produtos:
- Portal: www.gestaoct.org.br - lançado em junho de 2001;

- Gestão C&T online – Lançado em maio de 2000, primeiramente semanal e, posteriormente, bissemanal. É enviado a 8.630 assinantes em todo o Brasil e no exterior (México, Espanha, Uruguai, Moçambique); 

- Gestão C&T impresso – Lançado em outubro de 2000, é um informativo mensal, com tiragem de 6.600 exemplares. Editado até abril de 2008 - edição de número 91. 

- Informe ABIPTI - A equipe do Gestão C&T passou, a partir do ano de 2002, a assumir a produção e edição da publicação institucional da ABIPTI, o Informe ABIPTI, existente desde o início da Associação, em 1980. O informativo, que estava em seu 28º ano, foi publicado até abril de 2008. 

- Outros produtos - Ao longo dos anos vários produtos foram feitos pela equipe: coberturas exclusivas in loco de eventos anuais; cadernos temáticos como os voltados à Semana Nacional de C&T; informativos voltados ao setor do agronegócio e energias alternativas; entre outros.

Equipe:
A equipe do Gestão C&T sempre foi composta por um coordenador geral, um jornalista editor, jornalistas redatores, um profissional de design e estagiários de comunicação, além de um suporte de informática.